自動化工程科成立於民國77年8月1日，大學部成立於民國86年，主要在培育優秀自動化工程專業人才，提昇我國自動化產業的人力素質。本系強調理論與實務並重之教學，重視學生獨立思考與創造能力之培養。本校因地處中部科學園區虎尾基地旁，是中台灣創新科技發展重心之一。

無論是精密機械、光電產業或其他高科技產業，對精密度的要求皆很高，要達到高精密度，必須仰賴高級控制系統技術與光學檢測系統技術，而要將開發的技術應用在產品上時皆需要機電光系統技術配合，要進行國際競爭力需藉助於創新設計與可行性評估，尤其在產品化技術需具有機械設計製造與分析技術來實現。目前台灣由於勞動成本提高，很多產業已陸續將生產與研發基地外移，因此為持續提昇台灣高科技產業的產值與競爭力，須培訓自動化工程專業人才。本系配合國家精密機械發展與工業技術向下扎根及企業對自動化技術需求，建構在本系特色與能量，著重於機電光整合系統，發展重點以系統整合、自動控制、製造管理等技術為發展主軸，分機械/製造管理、自動控制系統、量測/系統整合三組，課程規劃分成機械、資訊管理、控制技術、量測與機電整合等五大領域，針對基礎、專業、進階與實作等課程進行授課，實驗室分成共通實驗室與特色實驗室，培訓學生具有自動化工程之系統智能與技術能力。

本系目前教師15位專任與2位兼任教師，四技生418位與碩士生56位學生，生師比為29.6。

本系特色為機電光整合系統，發展重點以系統整合、自動控制、製造管理等技術為發展主軸，分機械/製造管理、自動控制系統、量測/系統整合三組，課程規劃分成機械、資訊管理、控制技術、量測與機電整合等五大領域，針對基礎、專業、進階與實作等課程進行授課，實驗室分成共通實驗室與特色實驗室，培訓學生具有自動化工程之系統智能與技術能力。

本系教學特色有

1. 基礎理論與實務實作配合，分成基礎、專業與實務等課程，其中，系專業必修課程尤其著重實務技術的訓練，理論部分15學分15小時，實習部分10學分26小時，總必修學分時數99小時，實習時數37小時，占1/3，並於專業選修課程亦著重理論與實務實習演練並重，以符合技職體系之特色，另本系製造組44學分48小時，控制組34學分40小時，機電整合組50學分57小時，三組於教學平均並重。
2. 具有產業實務經驗與執行產學計畫師資占93.3%
   • 本系教師有15位師資，其中，14位具有博士學位，7位教授，5位副教授，3位助理教授，具有業界實務經驗與執行產學計畫教師有14位，占教師人數93.3%；
   • 林博正、蔡榮鋒與卓信鴻等三位教師以技術報告升等教授與助理教授。
3. 師資專長與系所教學研究吻合
   本系專業專任教師專長可參照師資陣容一頁，本系合格專業專任教師計有十五位與二位兼任教師，依課程規劃與發展重點，分為控制技術、機電系統技術與製造/管理技術等三組以配合教學，因而本系師資專長包括機械(9位)、電機(4位)、工程科學(1位)與工業工程(1位)等。依專長與教學，本系教師分組為
   • 控制技術：沈金鐘、何信璋、蔡榮鋒、李廣齊、陳世欣、卓信鴻
   • 機電系統技術：覺文郁、謝文祥、季永炤、郭如男、李孟澤、李政道
   • 製造/管理技術：林博正、蔡明標、鄭耀昌、楊登宇(兼任)、蔡銘焜(兼任)
4. 教師具有產學合作執行能力與實務成果，96-101學年內產出有
   • 國外專利9件、國內發明專利76件；
   • 技術移轉共26件；
   • 國科會專題研究計畫案48件；
   • 國科會產學計畫案15件
   • 國科會其他案件3件
   • 教育部委訓計畫3件
   • 教育部產學計畫案10件
   • 教育部其他案件4年
   • 政府部會其他案件1件
   • 企業產學計畫案21件
   • 其他單位產學計畫案2件
   • 校內補助案9件
5. 具有前瞻性與創新性技術開發能力
   • 奈米量測與控制技術應用於壓印設備定位精度達 ±20nm，精度達奈米等級；
   • 覺文郁教授「一種使用雷射二極體及四象儀檢測旋轉軸誤差」獲得93年經濟部國家發明獎金牌獎；
   • 蔡榮鋒教授「廣角度噴射式曝氣設備」獲得95年經濟部國家發明獎金牌獎；
   • 創新技術包括光路設計、精密量測技術、精密系統平台、創新關鍵性零組件與精密控制技術、微機電系統與元件等，具有國內外專利技術產出。

本系15位教師，產出計有77篇國際期刊論文、9件國外專利、76件國內專利、26件技轉，合計188篇/件產出，平均每位教師12.53篇/件產出。

1. 本校5年內國內專利獲證179件，國外專利獲證6件，其中，本系國內專利獲證51件，占全校28.5%，國外專利獲證4件，占全校66.7%
2. 本校5年內技轉案(含先期技轉)251件，技轉金3379萬元，每件技轉案技轉金為13.46萬元，其中，本系技轉27件，占全校10.8%，技轉金741萬元，占全校21.9%，每件技轉案技轉金為27.44萬元
3. 本校5年內一般技轉案42件，技轉金2140萬元，每件技轉案技轉金為50.65萬元，其中，本系技轉12件，占全校28.6%，技轉金645萬元，占全校30.1%，每件技轉案技轉金為53.75萬元
4. 本校5年內公民營計畫案425件，研究金額28526.7萬元，每件計畫研究金額為67.12萬元，其中，本系計畫案24件，占全校5.65%，研究金額4465.7萬元，占全校15.65%，每件技轉案技轉金為186萬元
5. 本系5年內合作計畫案計有106件，每位老師平均每年執行1.33件計畫案。

本系位於綜合工程一館三至五樓，樓板面積約4400平方公尺，另有學校分配給系上使用之三間普通教室，面積約234平方公尺，空間之使用如表0-2所示。目前除了系辦公室、會議室與兩間專業教室外，還有下列之配合教學與研究之實驗室：

1. 本系每位教師除了分配有個人研究室(約16平方米)外，另分配有個人專題製作實驗室(約14平方米)以做為指導學生專題製作之空間。
2. 實習實驗教學實驗室計有：電腦輔助工程實驗室、微處理機實驗室、機電實驗室、感測與量測實驗室、電工實驗室、控制工程實驗室與綜合電子實驗室，以上實驗室主要提供四技部進行基礎實驗與實習使用。
3. 研究用實驗室計有：多軸工具機校正實驗室、製商整合實驗室、智能系統實驗室、鏟配實驗室、精密量測與微光機電系統實驗室、創新機構實驗室、影像控制與噴霧應用實驗室，以上實驗室主要提供給教師執行研究計畫案及指導研究生(專題生)使用。就目前來說，教師研究與指導研究生明顯上空間不足。

又與業界進行產學合作的機會，由廠商捐贈實務機台，有在地型學界科專實驗室中銀泰科技公司的熱溫升測試機與自動化工廠的台勵福公司沖壓試驗機。另本年度台達電公司提供本系相關PLC設備有PLC主機(DVP32ES200R)、I/O擴充模組(DVP16XP211R)、AD/DA模組(DVP06XA-E2)與人機介面(DOP-B05S101)等各32套，約45.8萬元。。另99年本系與台達電公司合作於微處理機實驗室建立「台達自動化實驗中心」，分別由台達電子公司捐贈PLC主機、I/O擴充模組、AD/DA模組與人機介面等458,560元設備，與友士公司捐贈伺服馬達、驅動器與人機介面等646,800元設備，合計110萬元PLC相關教學模組，除整合現有教學資源與產業實務技術，培訓學生學習系統整合與實務實作課程，使系統整合應用觀念與產業接軌，發展產業合作應用實例，培訓產業需求實務人才，並與設備與台達電子公司進行建教合作或實習，提供公司基礎人才。